Doktora
EGE ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOTEKNOLOJİ (DR),
Arş. Gör. SİNEM YILMAZ
Biyoteknoloji Moleküler Biyoloji
Genel Bilgiler
Kurum Bilgileri
- Kurum Bilgi RAFET KAYIŞ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK ANABİLİM DALI
- UnvanARAŞTIRMA GÖREVLİSİ
İletişim Bilgileri
- Ofis GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ
- AdresRAFET KAYIŞ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ
Biyografi
Scopus Bilgisi Girilmemiştir
Google Scholar Bilgisi Girilmemiştir.
WOS Bilgisi Girilmemiştir.
Araştırma Alanları
Biyoteknoloji
Moleküler Biyoloji
Eğitim Bilgileri
Eğitim Bilgileri
-
2017
-
2011 2007
Lisans
EGE ÜNİVERSİTESİ, MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ,BİYOMÜHENDİSLİK PR.
-
2015 2013
Yüksek Lisans
EGE ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOMÜHENDİSLİK (YL) (TEZLİ),
Yaptığı Tezler
Deneyimler
Akademik Unvanlar
-
2023
ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ
ALANYA ALAADDİN KEYKUBAT ÜNİVERSİTESİ, MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ, ALANYA ALAADDİN KEYKUBAT ÜNİVERSİTESİ/MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ/GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ/GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK PR. (İNGİLİZCE)/
-
2018
ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ
EGE ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, EGE ÜNİVERSİTESİ/FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ/
Yönetimsel Görevler
Verilen Dersler
Yayınlar & Eserler
MAKALELER
Design, synthesis, and biological evaluation of some novel naphthoquinone‐glycine/β‐alanine anilide derivatives as noncovalent proteasome inhibitors
TATAR İREM, UYSAL ŞİRİN, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, SOYER ZEYNEP Chemical Biology & Drug Design,cilt.101, ss.-, 2023 (SCI-Expanded dergi )
Potent telomerase activators from a novel sapogenin via biotransformation utilizing Camarosporium laburnicola, an endophytic fungus
KÜÇÜKSOLAK MELİS, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL Springer Science and Business Media LLC,cilt.22, ss.-, 2023 (SCI-Expanded dergi )
Novel regulation mechanism of adrenal cortisol and DHEA biosynthesis via the endogen ERAD inhibitor small VCP-interacting protein
İLHAN RECEP, ÜNER GÖKLEM, YILMAZ SİNEM, Atalay Sahar Esra, ÇAYLI SEVİL, ERZURUMLU YALÇIN, GÖZEN OĞUZ, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Springer Science and Business Media LLC,cilt.12, ss.-, 2022 (SCI-Expanded dergi )
Induction of Divergent Cell Death Pathways by Urea and Carbohydrazide
Derivatives
YILMAZ SİNEM, TOK FATİH, Atalay Sahar Esra, KAYMAKÇIOĞLU BEDİA, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Bentham Science Publishers Ltd.,cilt.22, ss.-, 2022 (SCI-Expanded dergi )
The role of cycloastragenol at the intersection of NRF2/ARE, telomerase, and proteasome activity
YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Elsevier BV,cilt.188, ss.105-116, 2022 (SCI-Expanded dergi )
Telomerase activators from 20(27)-octanor-cycloastragenol via biotransformation by the fungal endophytes
DUMAN SEDA, EKİZ DİNÇMAN GÜNER, YILMAZ SİNEM, YUSUFOĞLU HASAN, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL Bioorganic Chemistry,cilt.109, ss.-, 2021 (SCI-Expanded dergi )
Neuroprotective activity studies of some phenylacetamide derivatives bearing 1H-pyrazole or 1H-1,2,4-triazole
SAYLAM MERVE, TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Bioorganic and Medicinal Chemistry Reports,cilt., ss.-, 2021 (ProQuest dergi )
A new underlying mechanism for the neuroprotective effect of bosutinib: Reverting toxicity\u2010induced PARylation in SIN1\u2010mediated neurotoxicity
YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, Alkan Tolgac Journal of Biochemical and Molecular Toxicology,cilt.35, ss.-, 2021 (SCI-Expanded dergi )
Screening of cytotoxicity and DNA topoisomerase IIa inhibitory activity of Turkish Onosma species
GÜZEL ÖZGE, DUMAN SEDA, YILMAZ SİNEM, KARAKOYUN ÇİĞDEM, KUL DEMET, PİRHAN ADEMİ FAHRİ, BEDİR ERDAL TURKISH JOURNAL OF BOTANY,cilt.45, ss.-, 2021 (SCI-Expanded dergi )
Design, synthesis and biological evaluation of novel naphthoquinone-4-aminobenzensulfonamide/carboxamide derivatives as proteasome inhibitors
UYSAL ŞİRİN,SOYER ZEYNEP,SAYLAM MERVE,TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK European Journal of Medicinal Chemistry,cilt.209, ss.-, 2021 (SCI dergi )
Neuroprotective activity studies of some phenylacetamide derivatives bearing 1H-pyrazole or 1H-1,2,4-triazole
SAYLAM MERVE, TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE, YILMAZ SİNEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK Bioorganic and Medicinal Chemistry Reports,cilt., ss.-, 2021 (ProQuest, Google Scholar dergi )
Polyethers isolated from the marine actinobacterium Streptomyces cacaoi inhibit autophagy and induce apoptosis in cancer cells
Khan Nasar,YILMAZ SİNEM,Aksoy Semiha,UZEL ATAÇ,TOSUN ÇİĞDEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL Chemico-Biological Interactions,cilt.307, ss.167-178, 2019 (SCI dergi )
Microbial Transformation of Cycloastragenol and Astragenol by Endophytic Fungi Isolated from Astragalus Species
EKİZ GÜNER,YILMAZ SİNEM,YUSUFOGLU HASAN,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL Journal of Natural Products,cilt.82, ss.2979-2985, 2019 (SCI dergi )
Hypericum perforatum L.: An overview of the anticancer potencies of the specimens collected from different ecological environments
GÖNENÇ TÜBA, Öztürk Munir, TÜRKSEVEN SÜLEYMAN GÜRDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, Günal Selin, YILMAZ SİNEM Pakistan Journal of Botany,cilt.52, ss.1003-1010, 2019 (SCI-Expanded dergi )
Design, synthesis, biological evaluation and molecular docking of novel moleculesto PARP-1 enzyme
TOK FATİH,KAYMAKÇIOĞLU BEDİA,İLHAN RECEP,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,TAŞKIN TOK TUĞBA TURKISH JOURNAL OF CHEMISTRY,cilt.43, ss.1290-1305, 2019 (SCI-Expanded dergi )
A Src/Abl kinase inhibitor, bosutinib, downregulates and inhibits PARP enzyme and sensitizes cells to the DNA damaging agents
BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,İLHAN RECEP,YILMAZ SİNEM,GUNAL SELIN,ERBAYKENT TEPEDELEN BURCU TURKISH JOURNAL OF BIOCHEMISTRY-TURK BIYOKIMYA DERGISI,cilt.43, ss.101-109, 2018 (SCI dergi )
KONFERANS & SEMPOZYUM & HAKEMLİ KONGRE & ULUSAL TOPLANTI & BİLDİRİ KİTAPLARINDA YER ALAN YAYINLAR
Utilization of Biotransformation to Obtain Novel Bioactives Towards Cellular Regeneration and Healthy Aging
KÜÇÜKSOLAK MELİS, YILMAZ SİNEM, ÜNER GÖKLEM, KURU GÜLTEN, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL
2. ULUSLARARASI GIDA KİMYASI KONGRESİ, ANTALYA, TÜRKİYE , ss.-, 2023.03.16
İdentification of novel cycloastragenol derivatives as potent NRF2 activators that delay replicative senesence
YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK
3rd BenBedPhar Scientific meeting, , TÜRKİYE , ss.-, 2022.10.14
İki Ucu Keskin Bıçak: Hücrede Ölüm ve Kalımda Sapogenoller
YILMAZ SİNEM, ÜNER GÖKLEM, KÜÇÜKSOLAK MELİS, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL
XXIV. BİTKİSEL İLAÇ HAMMADDELERİ TOPLANTISI, Ankara, TÜRKİYE , ss.-, 2022.06.23
20(27)-Octanor-Sikloastragenol’ün Mikrobiyal Transformayonu veElde Edilen Metabolitlerin Telomeraz Aktivasyonu Üzerine Etkileri
Duman Seda,EKİZ GÜNER,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL
TMC 2020, , TÜRKİYE , ss.-, 2020.12.27
Telomerase activators derived from Astragalus sapogenins via biotransformation with the recently discovered endophytic fungus Camarosporium laburnicola
KÜÇÜKSOLAK MELİS,EKİZ GÜNER,duman seda,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,BEDİR ERDAL
67th International Congress and Annual Meeting of the Society for Medicinal Plant and Natural Product Research (GA), Innsbruck, AVUSTURYA , ss.1451-1451, 2019.12.13
Neuroprotective Evaluation of Some Phenylacetamide Derivatives Bearing 1,2,4-Triazole with Metal Binding Property
SAYLAM MERVE, YILMAZ SİNEM, PARLAR ÇOŞKUN SÜLÜNAY, TARİKOĞULLARI DOĞAN AYŞE HANDE
MuTaLig COST ACTION CA15135 3rd Annual Meeting 2018, Valetta, MALTA , ss.79-79, 2018.10.18
Screening of Onosma Species for Cytotoxic Activity
Güzel Özge,Duman Seda,YILMAZ SİNEM,PİRHAN ADEMİ FAHRİ,BEDİR ERDAL
International Conference on Natural Products for Cancer Prevention and Therapy, , , ss.-, 2017.11.17
Effect of a New Sapogenol Derivative (AG-07) onCell Death via Necrosis
ERZURUMLU YALÇIN,tağ özgür,YILMAZ SİNEM,BEDİR ERDAL,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK
2nd International Conference on Natural Products for Cancer Prevention and Therapy, , , ss.996-, 2017.11.11
Yeni PARP İnhibitör Bileşiklerinin Taranması
GÜNAL SELİN,İLHAN RECEP,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,ERBAYKENT TEPEDELEN BURCU
ULUSAL TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK KONGRESİ, , TÜRKİYE , ss.-, 2017.10.25
Utilization of endophytic fungi for biotransformation to obtain bioactive compounds
BEDİR ERDAL, KÜÇÜKSOLAK MELİS, YILMAZ SİNEM, ÜNER GÖKLEM, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK
XVII OPTIMA Meeting, Erice-Palermo, İTALYA , ss.-,
Identification of novel Cycloastragenol derivatives as potent NRF2 activators that delay replicative senescence
YILMAZ SİNEM, KÜÇÜKSOLAK MELİS, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK, BEDİR ERDAL
The 20S proteasome degradation pathway, Rehovot, İSRAİL , ss.-,
The proteasome activatory property of Cycloastragenol is
dependent on the Nrf-2 mediated induction of telomerase activity
YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK
Redox Alterations and Cellular Responses: From Signalling to Interventions,FEBS Advanced course, Atina, YUNANİSTAN , ss.-,
The proteasome activator function of cycloastragenol is dependent on the NRF-2 mediated induction of telomerase activity
YILMAZ SİNEM, BEDİR ERDAL, BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK
First annual meeting of the ProteoCure COST Action, , SLOVENYA , ss.-,
Bioassay Guided Isolation of Naphthoquinones from Onosma aksoyii, Investigation of Their Cytotoxic Properties
KUL DEMET,KARAKOYUN ÇİĞDEM,YILMAZ SİNEM,PİRHAN ADEMİ FAHRİ,BEDİR ERDAL
67th International Congress and Annual Meeting of the Society for Medicinal Plant and Natural Product Research, , , ss.-,
DESIGN, SYNTHESIS AND BIOLOGICAL ACTIVITY STUDIES OF NOVEL NAPHTOQUINONE-AMINO ACID DERIVATIVES ASPROTEASOME INHIBITORS
TATAR İREM,YILMAZ SİNEM,BALLAR KIRMIZIBAYRAK PETEK,SOYER ZEYNEP
6th EFMC Young Medicinal Chemist Symposium, , , ss.-,
KİTAP & KİTAP BÖLÜMLERİ
Editörlükler
Proje & Patent & Tasarım
Projeler
-
21.12.2023 16.08.2022
Doğal kaynaklı yeni moleküllerin potansiyel nöroprotektif etkilerinin belirlenmesi
Nörodejeneratif hastalıklar, nöron hücrelerinin ölümünden kaynaklanan ve genellikle yaşlılıkla ilişkilendirilen bir grup hastalığı kapsamaktadır. Türkiye gibi gelişmekte olan toplumlarda nüfusun hızla yaşlanması, NDH’ların görülme sıklığını arttırmakta ve bu durum hem aileler hem de sağlık sistemi üzerinde büyük bir yük oluşturmaktadır. Mevcut tedavilerin sadece semptomatik fayda sağlaması da NDH’ları en önemli sağlık sorunlarından biri haline getirerek etkin tedavi keşfinin önemine dikkat çekmektedir. NDH’lar patolojik mekanizmaları birbirinden oldukça farklı çeşitli nörolojik bozuklukları içerse de artmış oksidatif stres ortak etiyolojilerden biri olarak öne sürülmekte ve oksidatif dengeyi korumaya yönelik yaklaşımlar NDH’ların tedavisi için umut vaat etmektedir. Hem literatürde yapılan çalışmalar hem de proje ekibimizin önceki çalışmaları Astagalus türlerinden elde edilen bir sapogenin olan sikloastrogenol’ün (SA) hücrenin oksidatif strese karşı en önemli koruma mekanizmalarından biri olan Nrf-2 yolağının aktivasyonu ile nöroprotektif etki gösterdiğini kanıtlamıştır. Bu verilerden yola çıkarak gerçekleştirdiğimiz ön çalışmalar yine Astragalus türlerinden izole edilen siklosefagenol’ün (SF) de potent bir nöroprotektif molekül olduğunu göstermiştir. Bunun üzerine ön çalışmalarımız kapsamında mikrobiyal biyotransformasyon ile 20 adet yeni SF türevi elde edilmiştir. Proje önerimizde ise literatür için yeni olan 20 metabolitin nöroprotektif etkisinin taranması ve yapı-etki ilişkisinin ortaya konulması planlanmıştır. Ayrıca seçilecek en aktif moleküllerin reaktif oksijen türleri oluşumu, mitokondriyal hasar ve Nrf-2 aktivitesi üzerine etkileri incelenerek aktivite mekanizmaları ile ilgili bilgi edinilecektir. Literatürde SF ve türevleri ile ilgili herhangi bir biyolojik aktivitenin olmaması proje önerimiz kapsamında elde edilecek verileri oldukça özgün kılmaktadır. Ülkemizin doğal kaynaklarından elde edilmiş bir ilaç adayına odaklanmayı hedefleyen projeden olumlu sonuçlar elde edilmesi grubumuzu ileri çalışmalar için teşvik edecektir.
Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
ULUSAL , Tamamlandı -
26.09.2023 01.10.2019
Bu projenin temel amacı 2017/GE/398510 evrak numaralı patent başvurusunda tanımlanan bazı telomeraz aktivatörü moleküllerin yaşlanma ve nörodejeneratif hastalıkların patogenezinde önemli rolü olan Nrf-2 sinyal yolağı ve Ubikitin Proteazom Sistemi üzerindeki etkilerinin ve söz konusu yolaklar arasındaki olası etkileşimlerin araştırılmasıdır.
-Tübitak 1001
ULUSAL , Tamamlandı
Patentler
-
WO2019/070219 A2
Production Method of Telomerase Activatord and Telomerase Activators Obtained by This Method
SECTION A - HUMAN NECESSITIES
Erdal Bedir,Petek Ballar Kırmızıbayrak,Güner Ekiz,Sinem Yılmaz,Seda Duman,Melis Küçüksolak İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü,Ege Üniversitesi -
: TR 2017 14942
TELOMERAZ AKTİVATÖRLERİNİN ÜRETİM YÖNTEMİ VE BU YÖNTEMLE ELDE EDİLEN TELOMERAZ AKTİVATÖRLERİ
SECTION A - HUMAN NECESSITIES
ERDAL BEDİR,PETEK BALLAR KIRMIZIBAYRAK,GÜNER EKİZ,SİNEM YILMAZ,SEDA DUMAN,MELİS KÜÇÜKSOLAK İZMİR YÜKSEK TEKNOLOJİ ENSİTİTÜSÜ,EGE ÜNİVERSİTESİ REKTÖRLÜĞÜ
Tasarımlar
Bilimsel Çalışmalar
BİLİMSEL ÇALIŞMALAR
-
13.05.2020 04.05.2020
Deney HayvanlarıKullanım Sertifikası Kursu
Bu programın amacı, deney hayvanları ile yapılacak olan bilimsel araştırma, test, sağlık hizmetleriuygulamaları, eğitim-öğretim ve yayın gibi temel etkinliklerde yer alacak kişilerin kullanılacak yöntemve materyaller ile ilgili etik standartları uygulayabilecek ve etik ilkeler doğrultusunda çalışacakehliyete sahip olmalarının sağlanmasıdır. Araştırmacılara Deney Hayvanları ile çalışırken uymalarıgereken mevzuat, etik kurallar, hayvanların anatomi, fizyoloji, histolojileri ve biyokimyasal özelliklerigibi derslerin yanı sıra, hastalıkları, bakım besleme ve üremeleri ile ilgili bilgiler, temel ve özel çalışmamodelleri ile denemelerde uygulanan yöntemler uygulamalı olarak verilecektir. Başarılı olanlar“Deney Hayvanı Kullanım Sertifikası” almaya hak kazanacaklardır. Bu kurs programı TC. Tarım veOrman Bakanlığı, Deney Hayvanları Kullanım Sertifikası Eğitim Programına Dair Genelge (2019/3)kapsamında akredite bir kurstur. DEU Multidsiplin Deney Hayvanları Laboratuvarı
Ulusal